在日韓国人との入籍、出産

今未婚で妊娠6ヶ月です。私は日本人、彼は在日韓国人です。帰化をするつもりで今準備をしているみたいです。生まれた子供の籍が自分に入らない？のが嫌でと言っておりました。実際はどうなんですか？出産前に入籍の場合と、帰化後に入籍の場合は子供は父親の居ない子供になるのでしょうか？帰化後の入籍は、子供が生まれてからになってしまいます。手続きが間に合わないかもしれないので。私生児にはしたくないのですが、どの流れでしたら良いでしょうか。